Na quinta temporada, as garotas finalmente terminam o colegial, e começam a estudar na Universidade de Malibu. Uma penthouse (cobertura) é construída pela WOOHP, para que as meninas possam viver juntas e continuar com seu trabalho como espiãs. Clover começa um romance com Blaine, que se torna seu primeiro namoro fixo. Também conhecemos Mindy, prima de Mandy, que se torna sua companheira de quarto na mesma universidade das garotas. No final da temporada, o mal é retirado da Terra, e as espiãs finalmente podem focar em suas vidas como estudantes universitárias.
