Situado em um futuro próximo, o Dr. Nobuhiko Komyoji era o chefe do projeto de engenharia robótica “ARK Project” para usar robôs de forma pacífica para resolver problemas fora do controle humano. O Dr. Komyoji no entanto morreu durante uma experiência e um ano depois o projeto foi liderado por seu rival Kanzaki e o Ministro da Defesa Tsubakiya que havia começado a usar o projeto para seus próprios benefícios pessoais, em vez de sua finalidade inicial. Para reviver o projeto original, Jiro, o Andróide Kikaider, que possui o Circuíto de Consciência criado pelo Dr. Komyoji apareceu para proteger os filhos de seu criador, Mitsuko e Masaru, que têm a chave para completar o projeto.
