Os amigos Mamoru e Yuji são jovens sem objetivos presos a empregos monótonos e sem perspectivas em uma fábrica sombria de Tóquio. Mamoru, o mais anti-social dos dois, é obcecado por seu projeto pessoal de fazer com que uma medusa venenosa se acostume com água doce por meio da substituição gradual da água em seu tanque. Uma noite, ele inexplicavelmente mata a família de seu chefe e acaba sendo condenado à morte. Yuji decide levar adiante o experimento com a medusa, torna-se amigo do pai meio ausente de Mamoru e cria um vínculo com ele. Mas o apego de Yuji à medusa se torna ainda mais forte, e os problemas começam quando ele acidentalmente solta a criatura venenosa nos canais de Tóquio.
