Um grupo que se denomina “Individual Eleven” começa a cometer atos de terrorismo por todo o Japão. Enquanto os membros da Seção 9 investigam esta nova ameaça, o governo japonês encara uma crise à parte, com refugiados estrangeiros deslocados pela Terceira Guerra Mundial em busca de asilo no país. Mas conforme os membros da Seção 9 encontram continuamente o dirigente do Serviço de Inteligência, Gouda Kazundo, em seu caminho, eles começam a suspeitar de seu possível envolvimento nos eventos turbulentos que agitam o território japonês.
