Mãe e filho, andam através de uma pesada chuva. O filho, Yoki, vê estranhas criaturas flutuando nas montanhas, que então desaparecem. Ele não sabe que tais criaturas, os ‘mushi’, não podem ser vistas por homens comuns. De repente, há um deslizamento de terra e ambos são sugados. Uma mulher mushishi chamada, Nui, encontra a criança, que miraculosamente sobreviveu, e o pega para ela. Alguns anos depois, Yoki, já adulto e renomeado Ginko, não lembra de nada do ocorrido. Seu cabelo é branco como a neve e lhe falta um olhos. Ele agora viaja de cidade em cidade conhecendo pessoas que tiveram experiências complicadas com os mushi, e os ajuda com seus problemas.
